Zmluva je základná evidenčná jednotka programu. Zmluvu uzatvárajú, v intenciách programu, dve zmluvné strany. Môžeme rozlišovať vlastné zmluvy uzatvorené medzi vlastnou organizáciou a druhou zmluvnou stranou a iné zmluvy, uzatvorené napr. medzi organizáciami v zriaďovateľskej pôsobnosti vlastnej organizácie a druhou zmluvnou stranou.
Ku zmluve je možné evidovať dodatky zmlúv. V nastaveniach programu sa dá definovať, že dodatky sa evidujú iba ku ukončeným zmluvám, teda tým ktorým už uplynula doba platnosti.
Dodatok zmluvy môže byť zapísaný do evidencie programu až po jeho podpísaní a nadobudnutí účinnosti a platnosti alebo môže byť zaevidovaný už na začiatku celého procesu schvaľovania a podpisovania. Proces schvaľovania a podpisovania dodatku je možné zachytiť v evidencii úkonov ku dodatku.
Ku dodatku zmluvy, ak suma na dodatku má nenulovú hodnotu, alebo priamo na zmluvu je možné evidovať viazané finančné prostriedky z rozpočtu organizácie buď ako celú sumu alebo jednotlivo podľa obdobia.
Ku dodatku je možné uložiť do databázy prílohu. Môže to byť súbor ľubovoľného typu napr. oscanovaný text dodatku. Tak môže mať prístup ku týmto textom každý, kto má prístup ku záznamu dodatku. Priamo z programu je možné spúšťať program na scanovanie dokumentov.
Číslo dodatku pozostáva z dvoch položiek, čísla a roku uzatvorenia dodatku zmluvy. Program umožňuje vlastné číslovanie dodatkov zmlúv používateľom alebo čísla dodatkov zmlúv sú generované a prideľované programom. Prvý spôsob číslovania uprednostnia tie organizácie, u ktorých číslo dodatku zmluvy pozostáva z číslic a alfanumerických znakov, druhý spôsob číslovania dodatkov zmlúv uprednostnia organizácie, u ktorých čísla sú tvorené iba číslicami a sú prideľované v chronologickom poradí. Ak čísla prideľuje program, tak sú generované chronologicky v rámci zmluvy a roku.
Zo zoznamu dodatkov zmlúv je možné vytvárať tlačové výstupy v tvare zoznamu záznamov a je možné tiež vytvárať textové dokumenty. Tie sú generované šablónami textových dokumentov.
Proces schvaľovania a podpisovania zmluvy by mal byť prioritne zachytený v registratúrnom denníku organizácie. Program WinZmluvy je napojený na program IVeS Administratívny systém úradu, čo je program na vedenie registratúrneho denníka organizácie. Spojenie je obojstranné, a síce je možné preberať registratúrne záznamy z registratúrneho denníka a naopak zapisovať nové záznamy do registratúrneho denníka.