Na inštaláciu serverovskej ako aj klientskej časti APV WinZmluvy slúži inštalačný program "install.exe" na inštalačnom médiu. Má dva režimy.

Typická inštalácia
Program inštaluje všetky potrebné súčasti systému, serverovská aj klientska časť, na jeden počítač (databáza a program) a používateľ to nemôže ovplyvniť. Program nainštaluje relačnú databázu MSDE 2000, ak ešte na danom počítači nie je nainštalovaná relačná databáza MS SQL Server (MSDE 2000), databázu WinZmluvy_01 a program WinZmluvy spolu so systémovými nástrojmi programu (FrameWork 1.1 a CrystalReports), ak nie sú nainštalované.
Po spustení inštalácie sa najprv nainštaluje MSDE 2000, ak na počítači nie je nainštalovaná relačná databáza MS SQL Server 2000 a viac. Inštaláciu MSDE 2000 nemáte možnosť akokoľvek zmeniť, po ukončení jeho inštalácie je potrebné, podľa pokynov, reštartovať počítač a opäť spustiť inštalačný program a zvoliť Typickú inštaláciu.
V ďalšom kroku sa nainštaluje databáza WinZmluvy_01. K tomu je potrebné zadefinovať názov servera, názov databázového používateľa pre správcu a jeho heslo prístupu pre pripojenie sa na server. Ak máte nainštalované MSDE 2000, z inštalačného média, databázový používateľ správcu je "sa" a heslo je prázdne. Ako názov servera je možné ponechať reťazec "localhost", uviesť názov počítača alebo jeho IP adresu.

Tlačidlom Potvrdiť sa spustí inštalácia databázy. Po jej nainštalovaní budete vyzvaní na zaregistrovanie pridelenej licencie. Ide o načítanie licenčného súboru Install.ini, ktorý je dodávaný spolu s inštalačným médiom na diskete.

Tlačidlom Potvrdiť sa ukončí inštalácia databázy a pokračuje sa s inštaláciou klientskej časti, programu WinZmluvy spolu so systémovými nástrojmi, ak nie sú nainštalované. Protokol z inštalácie sa nachádza v adresári, ktorý je uvedený v úvodnom dialógovom formulári programu.
Používateľská inštalácia
Pri tomto type inštalácie máte pod kontrolou čo sa inštaluje a je možné si vybrať iba tie časti ktoré chcete inštalovať.

Voľbu Inštalácia MSDE zvoľte iba v prípade, že na danom počítači nie je nainštalovaná relačná databáza MS SQL Server 2000 a viac. Po nainštalovaní MSDE je potrebné reštartovať počítač.
Voľbu Inštalácia klienta WinZMLUVY zvoľte v prípade, že program WinZmluvy.exe nie je na danom počítači nainštalovaný. Ak chcete nainštalovať novú verziu klienta, to sa dá vykonať voľbou, z ponuky menu OS Windows Start / Programy / Evidencia zmlúv / Inštalácia novej verzie klienta.
Voľba Oprava databázového pripojenia
Databáza WinZmluvy má prideleného jedného databázového používateľa a heslo pod ktorým sa všetci používatelia programu WinZmluvy hlásia na databázu. Tieto údaje sú uložené v súbore WinZmluvySys.xml v programovom adresári APV WinZmluvy.
Opraviť databázového používateľa je potrebné napríklad po obnove databázy zo zálohy, kedy sa obnovia iba dáta ale databázový používateľ nie.

Databázového používateľa môžete zmeniť, čo sa týka hesla databázového používateľa zvoľte voľbu prednastavené heslo aplikácie WinZMLUVY, nakoľko obidva údaje musia byť v súbore WinZmluvySys.xml, pričom heslo je v komprimovanom tvare a zatiaľ nie je k dispozícii nástroj na uloženie komprimovaného hesla do xml súboru.
Voľba Vytvorenie inicializačnej databázy
Na jednom databázovom serveri je možné mať niekoľko databáz WinZmluvy a to s ktorou chcete pracovať, si zvolíte pri prihlásení sa do programu WinZmluvy. Názov každej z nich začína reťazcom "WinZmluvy_". Inštalačný program, pri inštalácii novej databázy, pridá ku danému reťazcu poradové číslo, ďalšie v poradí. Zoznam všetkých databáz WinZmluvy je uvedený v inicializačnej databáze.
Voľba Inštalácia databázy
Nainštaluje sa nová databáza WinZmluvy. Preddefinovaný názov je WinZmluvy + poradové číslo databázy, ďalšie v poradí. K tomu je potrebné tiež zadať adresár, kde sa nachádza scriptový súbor na jej vytvorenie.
Voľbou Aktualizácia databázy sa spúšťajú zmenové scripty, napr. pre prechod od nižšej verzie databázy na vyššiu. Pred spustením akéhokoľvek zmenového scriptu, program automaticky vytvorí zálohu zvolenej databázy do adresára, ktorý je uvedený na úvodnom formulári inštalačného programu. Zmenové scripty sú uložené na inštalačnom médiu v adresári Databáza / Aktualizácia. To ktorý zmenový script je potrebné spustiť záleží od verzie Vašej databázy. Číslo verzie databázy je súčasťou názvu zmenového scriptu. Napr. zmenový script winzmluvy_201_300.sql aktualizuje databázu verzie 2.01 na verziu 3.00 a je možné ho spustiť iba ak verzia Vašej databázy je 2.01.

Je možné si vybrať iba konkrétnu databázu pre aktualizáciu, ak ich máte viac, alebo aktualizovať všetky naraz ale ak majú to isté číslo verzie.
Voľbou Odinštalovanie databázy sa zmaže existujúca databáza. Predtým ale program automaticky vytvorí zálohu databázy do adresára, ktorý je uvedený na úvodnom formulári inštalačného programu.
Voľbou Registrovanie databáz (Licencovanie) je možné načítať nový licenčný súbor Install.ini.
Voľba Oprava názvu organizácie
Názov organizácie je jedným z údajov uvedených v licenčnom súbore a môže tiež slúžiť na identifikáciu databázy s ktorou chcete pracovať pri prihlásení sa do programu. Táto voľba slúži na opravu tohto údaja.
Pri každej voľbe v serverovskej časti je potrebné zadefinovať názov servera, názov databázového používateľa pre správcu a jeho heslo prístupu pre pripojenie sa na server. Ak inštalujete MSDE 2000, z inštalačného média ponechajte preddefinované hodnoty (databázový používateľ správcu je "sa" a heslo je prázdne). Ako názov servera je možné ponechať reťazec "localhost", uviesť názov počítača alebo jeho IP adresu.